施威扬

发布者:伍玥琪发布时间:2018-08-19浏览次数:11550

姓名:施威扬

学历/职称/职务:博士,教授

联系方式:

邮箱:wshi@tongji.edu.cn                          

电话:18221372248

地址:中国海洋大学鱼山校区科学馆2xx


工作经历

2017/01—至今     中国海洋大学海洋生命学院,筑峰工程特聘教授

2012/01—2016/12  同济大学生命学院,教授

2008/11—2011/09  美国加州大学伯克利分校,Research Specialist

2003/11—2008/10  美国加州大学伯克利分校,博士后


教育经历:

1997/08—2003/9  美国Washington University in St. Louis,博士

1993/09—1997/06  清华大学生物科学与技术系,学士


研究方向:课题组主要使用单细胞组学及生物信息学方法,研究海洋生物发育和生长过程中细胞多样性形成、组织器官分化、免疫调控等过程中基因网络对细胞命运/行为的调控。实验室研究涵盖了海鞘、文昌鱼、牡蛎、扇贝等多种海洋生物模型。

主要研究课题包括

1. 海洋生物胚胎发育的单细胞图谱构建

2. 水产养殖生物免疫系统的单细胞组学研究

3. 长非编码RNA的预测与功能研究


 实验室目前有硕士、博士及博士后位置开放,欢迎有发育生物学、细胞生物学或生物信息学等背景的有志青年加入我们的研究队伍。



主要学术成果:* 通讯作者


Hendrix, D, Levine, M & Shi, W* miRTRAP, a computational approach to systematically identify miRNAs in the simple chordate Ciona intestinalis. Genome Biology 2010, 11(4):R39


Christiaen, L, Wagner, E, Shi, W & Levine, M. Emerging Model Organisms: The Sea Squirt Ciona intestinalis. Cold Spring Harbor Protocols 2009 (12)


Shi, W., Hendrix, D, Levine, M & Haley, B. A distinct class of small RNA arising from pri-microRNA sequences in a simple chordate. Nature Structural and Molecular Biology 16, 183 - 189 (2009)


Shi, W.*, Peyrot, S., Munro, E. & Levine, M. FGF3 in the floorplate directs notochord convergent extension in the Ciona tadpole. Development 136, 23-28 (2009)


Shi, W. * & Levine, M. Ephrin signaling establishes asymmetric cell fates in an endomesoderm lineage of the Ciona embryo. Development 135, 931-40 (2008)


Beh, J., Shi, W., Levine, M., Davidson, B. & Christiaen, L. FoxF is essential for FGF-induced migration of heart progenitor cells in the ascidian Ciona intestinalis. Development 134, 3297-305 (2007)


Davidson, B., Shi, W., Beh, J., Christiaen, L. & Levine, M. FGF signaling delineates the cardiac progenitor field in the simple chordate, Ciona intestinalis. Genes Dev 20, 2728-38 (2006)


Shi, W., Levine, M. & Davidson, B. Unraveling genomic regulatory networks in the simple chordate, Ciona intestinalis. Genome Res 15, 1668-74 (2005)


Davidson, B., Shi, W. & Levine, M. Uncoupling heart cell specification and migration in the simple chordate Ciona intestinalis. Development 132, 4811-8 (2005).