学院刘涛教授参与的千种植物转录组计划取得重要成果

发布者:伍玥琪发布时间:2019-10-28浏览次数:508


1024日,中国海洋大学海洋生命学院刘涛教授作为合作作者完成的国际1KP项目千种植物转录组计划(One thousand plant transcriptomes and the phylogenomics of green plants)成果在国际著名杂志《自然》(Nature)发表。中国海洋大学和刘涛教授分别位列中国机构作者前列(第一顺序位次)。

该项目由加拿大阿尔伯塔大学Gane Ka-Shu Wong教授于200811月发起,来自130多个国家和地区的近200名科学家参与了这项工作。中国机构对本项目做出了杰出贡献,中国海洋大学刘涛教授负责大型海藻转录样本制备和进化分析,中国科学院北京基因组所于军研究员领衔负责转录组数据处理和注释,深圳华大基因科技有限公司负责转录组测序和组装,深圳市中国科学院仙湖植物园、东北农业大学、青岛农业大学、中国农科院深圳基因组所、中科院华南植物园以及云南农科院花卉研究所等单位也参与了数据分析工作。

国际1KP项目历时9年完成,是目前已完成的全球规模最大的基因组研究计划,总计有1124种植物(包括藻类220种)完成测序,该计划的研究为10亿年来的绿色世系植物从水生到陆生以及不同类群的进化提供了框架和背景知识。

绿色世系从水生向陆生及其不同类群进化的系统发育树

通讯员:金月梅

文章链接:https://www.nature.com/articles/s41586-019-1693-2