王师

发布者:伍玥琪发布时间:2018-04-26浏览次数:2279

 

姓名:王师

学历/职称/职务:教授/博导

联系方式:

邮箱:swang@ouc.edu.cn

电话:0532-82031969

地址:山东青岛鱼山路5号中国海洋大学海洋生命学院

实验室网站:http://www2.ouc.edu.cn/mollusk/index.asp

  

工作照:

学习工作简历:

1998~2002,中国海洋大学,学士学位,海洋生物技术与计算机科学双专业

2002~2007,中国海洋大学,博士学位,遗传学专业,研究方向: 贝类分子遗传学

2007~2009,美国得克萨斯大学奥斯汀分校,博士后,研究方向: 珊瑚遗传基因组学

2009~2010,美国得克萨斯大学奥斯汀分校,博士后,研究方向: 酒精成瘾的分子机理

2011至今,中国海洋大学,教授,研究方向: 贝类基因组学与分子遗传育种

科研领域描述:

主要从事海洋贝类基因组学及分子遗传育种学研究,近年来围绕国际前沿领域关键科学和技术难题展开攻关,取得系列重要科研成果。研发了一系列适用于非模式生物基因组学研究的新技术和新方法,为高效开展海洋生物基因组学研究提供关键技术手段。在海洋贝类分子育种资源开发、重要经济性状遗传解析、全基因组选择育种等方面取得重要进展,研究成果为建立国际先进的海洋贝类分子育种体系奠定重要基础。主持承担了国家“十二五”863重大项目课题,国家自然科学基金等多个科研项目;为国家优秀青年科学基金、山东省自然科学杰出青年基金获得者;获国家“万人计划”科技创新领军人才、首批教育部青年长江学者等荣誉称号以及首届中国水产青年科技奖、山东省青年科技奖。已在国内外主流学术刊物上发表SCI论文80余篇,研究成果发表在Nature MethodsNature Ecology & EvolutionNature CommunicationsNature Protocols等国际高水平期刊上。学术成果得到国内外同行的广泛关注和高度评价,成果入选2016年度中国海洋与湖沼十大科技进展。

代表性成果:(#共同第一;*通讯作者)

Note, for most recent publications, please visit: https://www.researchgate.net/profile/Shi_Wang3/

1.       Wang S#, Zhang J#, Jiao W#, Li J#, Xun X#, Sun Y#, Guo X#, Huan P#, Dong B, Zhang L, Hu X, Sun X, Wang J, Zhao C, Wang Y, Wang D, Huang X, Wang R, Lv J, Li Y, Zhang Z, Liu B, Lu W, Hui Y, Liang J, Zhou Z, Hou R, Li X, Liu Y, Li H, Ning X, Lin Y, Zhao L, Xing Q, Dou J, Li Y, Mao J, Guo H, Dou H, Li T, Mu C, Jiang W, Fu Q, Fu X, Miao Y, Liu J, Yu Q, Li R, Liao H, Li X, Kong Y, Jiang Z, Chourrout D*, Li R* & Bao Z*. (2017) Scallop genome provides insights into evolution of bilaterian karyotype and development. Nature Ecology & Evolution. 1: 0120. (在国际上首次完成扇贝基因组精细图谱绘制,在解析原始动物祖先基因组特征和发育进化调控机制等方面取得多项新发现和新认识,为理解动物早期起源和演化机制提供关键线索;被NEE选为当期封面文章,并刊发国际同行的专题评述文章《Genome evolution: Shellfish genes)

2.       Li Y#, Sun X#, Hu X#, Xun X#, Zhang J#, Guo X#, Jiao W, Zhang L, Liu W, Wang J, Li J, Sun Y, Miao Y, Zhang X, Cheng T, Xu G, Fu X, Wang Y, Yu X, Huang X, Lu W, Lv J, Mu C, Wang D, Li X, Xia Y, Li Y, Yang Z, Wang F, Zhang L, Xing Q, Dou H, Ning X, Dou J, Li Y, Kong D, Liu Y, Jiang Z, Li R, Wang S* & Bao Z*. (2017) Scallop genome reveals molecular adaptations to semi-sessile life and neurotoxins. Nature Communications. 8: 1721. (5-Yr IF: 13.1; 完成了栉孔扇贝首张高质量全基因组图谱绘制,利用多组学手段,深入解析了控制扇贝肌肉、视觉、足丝分泌、贝毒代谢等组学调控基础,为理解双壳贝类适应性性状的进化起源提供了新的认知)

3.       Wang S#,*, Meyer E#,*, McKay JK & Matz MV. (2012) 2b-RAD: a simple and flexible method for genome-wide genotyping. Nature Methods. 9: 808-810. (5-Yr IF: 36.7; 首次将IIB型内切酶应用于简化基因组测序,实现了RAD测序标签的等长化及高效获取,解决了国际同类技术流程复杂、成本高、灵活性差等技术瓶颈;该技术应用论文发表在包括ScienceeLifeGlobal Change BiologyNew Phytologist等国际权威期刊上)

4.       Wang S#,*, Liu P#, Lv J, Li Y, Cheng T, Zhang L, Xia Y, Sun H, Hu X & Bao Z*. (2016) Serial sequencing of isolength RAD tags for cost-efficient genome-wide profiling of genetic and epigenetic variations. Nature Protocols. 11: 2189-2200. (5-Yr IF: 13.3; 所创建的串联标签测序技术使得标签测序成本降低达90%,并在国际上首次实现全基因组SNP分型和DNA甲基化的同步联合分析,成果入选2016年度中国海洋与湖沼十大科技进展)

5.       Dou J#, Dou H#, Mu C, Zhang L, Zhou Z, Chang Y, Wang J, Li T, Li Y, Hu X, Wang S* & Bao Z*. (2017) Whole-genome restriction mapping by “subhaploid”-based RAD sequencing: an efficient and flexible approach for physical mapping and genome scaffolding. Genetics. 206: 1237-1250. (5-Yr IF: 5.1基于“人工减数分裂”的物理图谱构建和基因组拼接新技术,可对全基因组2b-RAD标签进行精准排序,并结合三代测序技术辅助基因组组装,用于解决高杂合、高复杂基因组拼接难题;被Genetics杂志选为当期网站主页推荐论文)

6.       Wang S#, Lv J#, Zhang L#, Dou J, Sun Y, Li X, Fu X, Dou H, Mao J, Hu X & Bao Z*. (2015) MethylRAD: a simple and scalable method for genome-wide DNA methylation profiling using methylation-dependent restriction enzymes. Open Biology. 5: 150130. (5-Yr IF: 4.8; 创建了高效、低成本全基因组DNA甲基化分析新技术,为该杂志当月阅读频率最高的研究型论文)

7.       Jiao W#, Fu X#, Dou J#, Li H, Su H, Mao J, Yu Q, Zhang L, Hu X, Huang X, Wang S* & Bao Z*. (2014) High-resolution linkage and quantitative trait locus mapping aided by genome survey sequencing: building up an integrative genomic framework for a bivalve mollusc. DNA Research. 21: 85-101. [5-Yr IF: 5.5; 所构建的扇贝高精度遗传图谱,为国际上首张精度突破0.5cM的水产生物遗传图谱,成功定位了控制扇贝生长性状的关键候选基因;被该杂志选为当期亮点文章(Featured article), 并被主编评价为具有里程碑(milestone)意义的工作,见http://www.oxfordjournals.org/our_journals/dnares/freeaccess_articles.html]

8.       Jiao W#, Fu X#, Li J#, Li L, Feng L, Lv J, Zhang L, Wang X, Li Y, Hou R, Zhang L, Hu X, Wang S* & Bao Z*. (2014) Large-scale development of gene-associated SNP markers for molluscan population genomic, comparative genomic and genome-wide association studies. DNA Research. 21: 183-193. (5-Yr IF: 5.5; 扇贝中迄今已发表的最大规模的基因区SNP标记开发工作)

9.       Ponomarev I*,#, Wang S#, Zhang L, Harris RA & Mayfield RD*. (2012) Gene co-expression networks in human brain identify epigenetic modifications in alcohol dependence. Journal of Neuroscience. 32: 1884-1897. [5-Yr IF: 6.6; highlighted by CNS & Neurological Disorders-Drug Targets杂志,评价“该工作为酒精或毒品成瘾的治疗提供了新的思路”(PMID: 22483287;已被Nature Neuroscience, Nature Reviews Neuroscience, PNAS等引用超过180]

10.   Wang S*, Zhang L, Meyer E & Matz MV. (2009) Construction of a high-resolution genetic linkage map and comparative genome analysis for the reef-building coral Acropora millepora. Genome Biology. 10: R126. (5-Yr IF: 13.6; 首张珊瑚遗传连锁图谱, highlighted by Genome Biology, 评价“为珊瑚生物学研究提供了必不可少的资源”, http://0-blogs.biomedcentral.com.brum.beds.ac.uk/on-biology/2009/11/10/the-coral-genetic-linkage-map-an-essential-resource-for-coral-biology/)