王师

发布者:杨光发布时间:2020-05-05浏览次数:6550

个人简历

姓名:王师

学历/职称/职务:教授/博导

联系方式:

邮箱:swang@ouc.edu.cn

电话:0532-82031969

地址:山东青岛鱼山路5号中国海洋大学海洋生命学院

实验室网站:http://www2.ouc.edu.cn/mollusk/index.asp

工作照:

学习工作简历:

1998~2002,中国海洋大学,学士,海洋生物技术与计算机科学双专业

2002~2007,中国海洋大学,博士,遗传学专业,研究方向: 贝类分子遗传学

2007~2009,美国德克萨斯大学奥斯汀分校,博士后,研究方向: 珊瑚遗传基因组学

2009~2010,美国德克萨斯大学奥斯汀分校,博士后,研究方向: 酒精成瘾的分子机理

2011至今,中国海洋大学,先后聘任“英才”、“筑峰”教授,研究方向: 海洋生物基因组学

科研领域描述:

主要从事海洋贝类遗传与基因组学研究,近年来围绕国际前沿领域关键科学和技术难题展开攻关,取得系列具有重要国际影响力的科研成果。研发了一系列适用于非模式生物基因组学研究的新技术和新方法,为高效开展海洋生物基因组学研究提供核心技术手段;在解析软体动物基因组特征和发育进化调控机制等方面取得多项新发现和新认识,为理解动物早期起源和演化机制提供关键线索;在海洋贝类分子育种资源开发、重要经济性状遗传解析等方面取得重要进展,研究成果为建立国际先进的海洋贝类分子育种体系奠定重要基础。主持承担了国家863重大、国家重点研发计划等项目课题;入选国家基金委优青、教育部青年长江学者、国家万人计划领军人才、山东省泰山学者特聘专家,并获教育部青年科学奖、中国动物学会青年科技奖、山东省青年科技奖等。已在国内外主流刊物发表论文上百余篇,以第一/通讯作者发表在Nature MethodsNature ProtocolsNature Ecology & EvolutionNature CommunicationsGenome ResearchGenome Biology等国际顶级期刊上。学术成果得到国内外同行的广泛关注和高度评价,成果连续入选20162017年度中国海洋与湖沼十大科技进展及2017年度中国海洋科技十大进展,获国家技术发明二等奖1项,省部级一等奖2项。

代表性成果:(#共同第一;*通讯作者)

Note, for most recent publications, please visit: https://www.researchgate.net/profile/Shi_Wang3/

  1. Wang J#, Zhang L#, Lian S#, Qin Z#, Zhu X#, Dai X, Huang Z, Ke C, Zhou Z, Wei J, Liu P, Hu N, Zeng Q, Dong B, Dong Y, Kong D, Zhang Z, Liu S, Xia Y, Li Y, Zhao L, Xing Q, Huang X, Hu X, Bao Z & Wang S*. (2020) Evolutionary transcriptomics of metazoan biphasic life cycle supports a single intercalation origin of metazoan larvae. Nature Ecology & Evolution. 4: 725-736. (5-Yr IF: 11.0;针对海洋幼虫起源这一学界争议近百年的科学难题,巧妙应用转录组年龄指数(TAI)分析法推演了幼虫的进化起源历史,揭示了后生动物幼虫阶段的起源晚于其成体阶段,从而否定了在学界长期占据主导地位的larva-first假说,并提出了海洋幼虫为单次插入起源的adult-first新理论学说NEE杂志网站以HeroImage形式对该论文予以重点推荐,并刊发国际同行的专题评述文章《The origin of metazoan larvae)

  2. Wang S#, Zhang J#, Jiao W#, Li J#, Xun X#, Sun Y#, Guo X#, Huan P#, Dong B, Zhang L, Hu X, Sun X, Wang J, Zhao C, Wang Y, Wang D, Huang X, Wang R, Lv J, Li Y, Zhang Z, Liu B, Lu W, Hui Y, Liang J, Zhou Z, Hou R, Li X, Liu Y, Li H, Ning X, Lin Y, Zhao L, Xing Q, Dou J, Li Y, Mao J, Guo H, Dou H, Li T, Mu C, Jiang W, Fu Q, Fu X, Miao Y, Liu J, Yu Q, Li R, Liao H, Li X, Kong Y, Jiang Z, Chourrout D*, Li R* & Bao Z*. (2017) Scallop genome provides insights into evolution of bilaterian karyotype and development. Nature Ecology & Evolution. 1: 0120. (5-Yr IF: 11.0;在国际上首次完成扇贝基因组精细图谱绘制,在解析原始动物祖先基因组特征、体轴和眼睛发育进化调控机制等方面取得多项新发现和新认识,为理解动物早期起源和演化机制提供关键线索;被NEE选为当期封面文章(cover story),并刊发国际同行的专题评述文章《Genome evolution: Shellfish genes》;已Google Scholar引用超过130)

  3. Li Y#, Sun X#, Hu X#, Xun X#, Zhang J#, Guo X#, Jiao W, Zhang L, Liu W, Wang J, Li J, Sun Y, Miao Y, Zhang X, Cheng T, Xu G, Fu X, Wang Y, Yu X, Huang X, Lu W, Lv J, Mu C, Wang D, Li X, Xia Y, Li Y, Yang Z, Wang F, Zhang L, Xing Q, Dou H, Ning X, Dou J, Li Y, Kong D, Liu Y, Jiang Z, Li R, Wang S* & Bao Z*. (2017) Scallop genome reveals molecular adaptations to semi-sessile life and neurotoxins. Nature Communications. 8: 1721. (5-Yr IF: 13.8;利用多组学手段,系统解析了扇贝肌肉、视觉、足丝分泌、贝毒代谢等组学调控基础,为理解贝类适应性性状的进化起源提供了新认知;highlighted by Toxicon杂志专题评述《Neurotoxin stress-driven evolution in scallop genome》,并与前述成果一并入选2017年度中国海洋科技十大进展)

  4. Wang S#,*, Meyer E#,*, McKay JK & Matz MV. (2012) 2b-RAD: a simple and flexible method for genome-wide genotyping. Nature Methods. 9: 808-810. (5-Yr IF: 35.0; 首次将IIB型内切酶应用于简化基因组测序,实现了RAD测序标签的等长化及高效获取,解决了国际同类技术流程复杂、成本高、灵活性差等技术瓶颈;该技术已被国内外广泛应用于上百种动植物、微生物,相关论文发表在包括ScienceeLifePLoS GeneticsGlobal Change Biology等国际权威期刊上;已Google Scholar引用超过350)

  5. Wang S#,*, Liu P#, Lv J, Li Y, Cheng T, Zhang L, Xia Y, Sun H, Hu X & Bao Z*. (2016) Serial sequencing of isolength RAD tags for cost-efficient genome-wide profiling of genetic and epigenetic variations. Nature Protocols. 11: 2189-2200. (5-Yr IF: 15.1; 创建了串联标签测序技术,使得单标签测序成本降低达90%,并在国际上首次实现全基因组范围SNP分型和DNA甲基化信息在单条测序read中的同步联合分析,成果被选为NP杂志网站Highlight论文,并入选2016年度中国海洋与湖沼十大科技进展)

  6. Lv J#, Jiao W#, Guo H#, Liu P, Wang R, Zhang L, Zeng Q, Hu X, Bao Z & Wang S*. (2018) HD-Marker: a highly multiplexed and flexible approach for targeted genotyping of more than 10,000 genes in a single-tube assay. Genome Research. 28: 1919-1930. (5-Yr IF: 11.6;创建了灵活高效的“液相分型芯片”技术,可灵活实现对多达10-100K已知基因位点进行高通量分析;突破了目前固相定制芯片平台费用高昂、灵活性差、难于大规模应用等技术瓶颈,为非模式生物提供了一种兼容不同通量级别、不同标记类型的高效灵活的靶向基因分型技术)

  7. Dou J#, Dou H#, Mu C, Zhang L, Zhou Z, Chang Y, Wang J, Li T, Li Y, Hu X, Wang S* & Bao Z*. (2017) Whole-genome restriction mapping by “subhaploid”-based RAD sequencing: an efficient and flexible approach for physical mapping and genome scaffolding. Genetics. 206: 1237-1250. (5-Yr IF: 4.6;创建基于“人工减数分裂”的物理图谱构建和基因组拼接新技术,可对全基因组酶切标签进行精准排序,并结合三代测序技术辅助基因组组装,用于解决高杂合、高复杂基因组拼接难题;被Genetics杂志选为当期网站主页推荐论文)

  8. Jiao W#, Fu X#, Dou J#, Li H, Su H, Mao J, Yu Q, Zhang L, Hu X, Huang X, Wang S* & Bao Z*. (2014) High-resolution linkage and quantitative trait locus mapping aided by genome survey sequencing: building up an integrative genomic framework for a bivalve mollusc. DNA Research. 21: 85-101. (5-Yr IF: 5.0; 所构建的扇贝高精度遗传连锁图谱,为国际上首张精度突破0.5cM的水产生物遗传图谱,精细定位了控制扇贝经济性状的重要候选基因;被该杂志选为当期唯一亮点论文(featured article), 并被主编评价为具有里程碑(milestone)意义的工作,见 http://www.oxfordjournals.org/our_journals/dnares/freeaccess_articles.html)

  9. Ponomarev I*,#, Wang S#, Zhang L, Harris RA & Mayfield RD*. (2012) Gene co-expression networks in human brain identify epigenetic modifications in alcohol dependence. Journal of Neuroscience. 32: 1884-1897.[5-Yr IF: 6.5; highlighted by CNS & Neurological Disorders-Drug Targets杂志,评价“该工作为酒精或毒品成瘾的治疗提供了新思路”(PMID: 22483287;已被Nature NeuroscienceNature Reviews NeurosciencePNAS等引用超过270]

  10. Wang S*, Zhang L, Meyer E & Matz MV. (2009) Construction of a high-resolution genetic linkage map and comparative genome analysis for the reef-building coral Acropora millepora. Genome Biology. 10: R126. (5-Yr IF: 18.4; 首张珊瑚遗传连锁图谱, highlighted by Genome Biology, 评价“为珊瑚生物学研究提供了必不可少的资源”,http://0-blogs.biomedcentral.com.brum.beds.ac.uk/on-biology/2009/11/10/the-coral-genetic-linkage-map-an-essential-resource-for-coral-biology/)